Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift52Q62559 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms