Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Trim28Q62318 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Trim28Q62318 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Trim28Q62318 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Trim28Q62318 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Trim28Q62318 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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Trim28Q62318 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim28Q62318 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim28Q62318 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim28Q62318 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim28Q62318 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim28Q62318 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim28Q62318 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim28Q62318 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim28Q62318 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim28Q62318 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
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