Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SypQ62277 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SypQ62277 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SypQ62277 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SypQ62277 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SypQ62277 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SypQ62277 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SypQ62277 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SypQ62277 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SypQ62277 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SypQ62277 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SypQ62277 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SypQ62277 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SypQ62277 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SypQ62277 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SypQ62277 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SypQ62277 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SypQ62277 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SypQ62277 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SypQ62277 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SypQ62277 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SypQ62277 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SypQ62277 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SypQ62277 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SypQ62277 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SypQ62277 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SypQ62277 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SypQ62277 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SypQ62277 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SypQ62277 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SypQ62277 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SypQ62277 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SypQ62277 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SypQ62277 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SypQ62277 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SypQ62277 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SypQ62277 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SypQ62277 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SypQ62277 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SypQ62277 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SypQ62277 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SypQ62277 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SypQ62277 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SypQ62277 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SypQ62277 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SypQ62277 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SypQ62277 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SypQ62277 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SypQ62277 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SypQ62277 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SypQ62277 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SypQ62277 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SypQ62277 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SypQ62277 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SypQ62277 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SypQ62277 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SypQ62277 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SypQ62277 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SypQ62277 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SypQ62277 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SypQ62277 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SypQ62277 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SypQ62277 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SypQ62277 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SypQ62277 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SypQ62277 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SypQ62277 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SypQ62277 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SypQ62277 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SypQ62277 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SypQ62277 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SypQ62277 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SypQ62277 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SypQ62277 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SypQ62277 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SypQ62277 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SypQ62277 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SypQ62277 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SypQ62277 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SypQ62277 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SypQ62277 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SypQ62277 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SypQ62277 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SypQ62277 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SypQ62277 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SypQ62277 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SypQ62277 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SypQ62277 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SypQ62277 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SypQ62277 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SypQ62277 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SypQ62277 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SypQ62277 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SypQ62277 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SypQ62277 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SypQ62277 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SypQ62277 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SypQ62277 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SypQ62277 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SypQ62277 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms