Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms