Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sall3Q62255 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
Sall3Q62255 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms