Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Rbm38Q62176 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbm38Q62176 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
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