Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd1Q62101 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Prkd1Q62101 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.5 ms