Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Odf1Q61999 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf1Q61999 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
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Odf1Q61999 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Odf1Q61999 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Odf1Q61999 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Odf1Q61999 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Odf1Q61999 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Odf1Q61999 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Odf1Q61999 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Odf1Q61999 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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