Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Npm1Q61937 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Npm1Q61937 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms