Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd53Q61451 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms