Protein–RNA interactions for Protein: Q61271

Acvr1b, Activin receptor type-1B, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1bQ61271 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acvr1bQ61271 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Acvr1bQ61271 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Acvr1bQ61271 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms