Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc1Q61056 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms