Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ift20Q61025 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms