Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JrkQ60976 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JrkQ60976 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JrkQ60976 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JrkQ60976 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms