Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp7Q60973 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms