Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms