Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms