Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

Predictions only

Length 3,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RelnQ60841 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RelnQ60841 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RelnQ60841 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RelnQ60841 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RelnQ60841 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RelnQ60841 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RelnQ60841 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RelnQ60841 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RelnQ60841 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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RelnQ60841 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RelnQ60841 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RelnQ60841 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RelnQ60841 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RelnQ60841 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RelnQ60841 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RelnQ60841 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RelnQ60841 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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