Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms