Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mkrn3Q60764 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms