Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms