Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnk2a1Q60737 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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