Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms