Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SkiQ60698 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SkiQ60698 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SkiQ60698 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SkiQ60698 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms