Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2f1Q60632 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms