Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms