Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema5bQ60519 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms