Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp13a3Q5XF89 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp13a3Q5XF89 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.1 ms