Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc11Q5U458 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms