Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brip1Q5SXJ3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms