Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Med13Q5SWW4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Med13Q5SWW4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms