Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsr1Q5SWD9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms