Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms