Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctc1Q5SUQ9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctc1Q5SUQ9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctc1Q5SUQ9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctc1Q5SUQ9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctc1Q5SUQ9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctc1Q5SUQ9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctc1Q5SUQ9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctc1Q5SUQ9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctc1Q5SUQ9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctc1Q5SUQ9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctc1Q5SUQ9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctc1Q5SUQ9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctc1Q5SUQ9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctc1Q5SUQ9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctc1Q5SUQ9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctc1Q5SUQ9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctc1Q5SUQ9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctc1Q5SUQ9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctc1Q5SUQ9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctc1Q5SUQ9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctc1Q5SUQ9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctc1Q5SUQ9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctc1Q5SUQ9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctc1Q5SUQ9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctc1Q5SUQ9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctc1Q5SUQ9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctc1Q5SUQ9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctc1Q5SUQ9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctc1Q5SUQ9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctc1Q5SUQ9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 276.1 ms