Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms