Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sco1Q5SUC9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms