Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam71bQ5STT6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms