Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf215Q5SPX3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms