Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms