Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms