Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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