Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

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Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp28Q5I043 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Usp28Q5I043 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp28Q5I043 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp28Q5I043 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp28Q5I043 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp28Q5I043 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp28Q5I043 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp28Q5I043 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp28Q5I043 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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