Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnni3kQ5GIG6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms