Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms