Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtl5Q5DTT4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms