Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms