Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms