Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms