Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox3aQ4TU90 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox3aQ4TU90 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox3aQ4TU90 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox3aQ4TU90 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox3aQ4TU90 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox3aQ4TU90 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3aQ4TU90 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3aQ4TU90 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3aQ4TU90 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3aQ4TU90 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3aQ4TU90 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3aQ4TU90 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3aQ4TU90 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3aQ4TU90 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3aQ4TU90 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3aQ4TU90 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3aQ4TU90 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3aQ4TU90 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3aQ4TU90 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox3aQ4TU90 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox3aQ4TU90 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox3aQ4TU90 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox3aQ4TU90 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox3aQ4TU90 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox3aQ4TU90 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox3aQ4TU90 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox3aQ4TU90 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox3aQ4TU90 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox3aQ4TU90 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox3aQ4TU90 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms