Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL66

Psg28, Pregnancy-specific glycoprotein 28, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psg28Q4KL66 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psg28Q4KL66 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psg28Q4KL66 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms